Dies ist eine alte Version des Dokuments!

neu aufgesetzt am 01.05.2009, um ein entschlacktes system zu erhalten. Paketbau NICHT mehr in remaster-root, sondern auf anderen Maschinen (oder in /home/ivo/Dokumente/sysbuntu/remaster-root), um die DVD nicht zuzumu

#bison #fuer manuelle OpenAlea-Installation celldesigner-4.0.1 copasi-4.4.29 dialog # fuer /etc/init.d/checklicense.sh #flex #fuer manuelle OpenAlea-Installation gnuplot libcgal-dev #fuer OpenAlea # libgnuplot-ruby #fuer manuelle OpenAlea-Installation libncurses5-dev #fuer OpenAlea libqhull5 #fuer OpenAlea #libqhull5-dev #fuer manuelle OpenAlea-Installation libsbml-3.3.2 libqt4-opengl-dev #fuer OpenAlea libwxgtk2.8-dbg #fuer xmlcopyeditor libxerces-c28 #fuer xmlcopyeditor libxerces2-java #fuer celldesigner python-epydoc python-gnuplot python-matplotlib python-numarray python-numeric python-numpy python-pyx python-qt4 python-rpy python-scipy #python-setuptools #fuer manuelle OpenAlea-Installation python-soappy semanticsbml-1.0.7 #scons #fuer manuelle OpenAlea-Installation texlive-latex-extra tide-1.2 xmlcopyeditor-1.2.0.2 xppauth-5.98

#fuer manuelle OpenAlea-Installation : ln -s /usr/lib/libqhull.so.5 /usr/lib/libqhull.so # ln -s /usr/lib/libglut.so.3 /usr/lib/libglutl.so

fuer OpenAlea: python-qt4 libboost-python1.34.1 python-scipy gnuplot libqhull5 python-matplotlib \

              libncurses5-dev libcgal-dev libqt4-opengl-dev texlive-latex-extra python-rpy
              libboost-python.so nach libboost_python.so.3 verlinken, alle "*.so"- Bibliotheken aus /usr/local/lib \
              muessen nach /usr/lib verlinkt werden, und aus libncurses.so.5 werden libtinfo.so und libtinfo.so.5.
              ...und laeuft...

noch nicht in *.deb ausgelagerte eigene Anpassungen liegen momentan im „alten“ sysbuntupfad unter usr/local/src/files4sbos

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0.3.2

Geänderte config für semanticSBML, SemanticSBML- Daten nach /opt verschoben, da semanticsbml in der config nicht mit \ relativen Pfaden umgehen kann Doku und Optik von ubuntu4systemsbiology befreit

0.3.3 Doku repariert (es fehlten die Videos!) …und gstreamer0.10-plugins-ugly + gstreamer0.10-ffmpeg fehlten Visualea startet mit xterm wegen Bug: VisuAlea plottet nur, wenn es eus einem Terminal gestartet wird.

0.3.4 Fehlerbereinigte TIde-Version 1.2.1 (Versionsnummer NICHT angepasst, sollte so bleiben) semanticSBML jetzt 1.0.8 usplash-theme erstellt (usplash-theme-sbos 0.3.4) IMMER ANPASSEN: remaster-iso/isolinux/*. Besonders auf Datum/Bezeichnung achten! SBMLsqueezer 1.1 installiert Desktop/Licenses links repariert

Weiterhin zu ändern: checklicense.sh (besser in initrd packen oder an den Beginn der inittab) –> nochmal versuchen!!! gfxboot-theme verändern remaster-iso/.disk/* ändern!!!