Dies ist eine alte Version des Dokuments!
- neu aufgesetzt am 01.05.2009, um ein entschlacktes system zu erhalten. Paketbau NICHT mehr in
remaster-root, sondern auf anderen Maschinen (oder in /home/ivo/Dokumente/sysbuntu/remaster-root), um die DVD nicht zuzumumüllen.
- celldesigner-4.0.1
- copasi-4.4.29
- dialog # fuer /etc/init.d/checklicense.sh
- gnuplot
- libcgal-dev #fuer OpenAlea
- libncurses5-dev #fuer OpenAlea
- libqhull5 #fuer OpenAlea
- libsbml-3.3.2
- libqt4-opengl-dev #fuer OpenAlea
- libwxgtk2.8-dbg #fuer xmlcopyeditor
- libxerces-c28 #fuer xmlcopyeditor
- libxerces2-java #fuer celldesigner
- python-epydoc
- python-gnuplot
- python-matplotlib
- python-numarray
- python-numeric
- python-numpy
- python-pyx
- python-qt4
- python-rpy
- python-scipy
- python-soappy
- semanticsbml-1.0.7
- texlive-latex-extra
- tide-1.2
- xmlcopyeditor-1.2.0.2
- xppauth-5.98
- fuer OpenAlea: python-qt4 libboost-python1.34.1 python-scipy gnuplot libqhull5 python-matplotlib libncurses5-dev libcgal-dev libqt4-opengl-dev texlive-latex-extra python-rpy libboost-python.so nach libboost_python.so.3 verlinken, alle „*.so“- Bibliotheken aus /usr/local/lib muessen nach /usr/lib verlinkt werden, und aus libncurses.so.5 werden libtinfo.so und libtinfo.so.5 …und laeuft…
- noch nicht in *.deb ausgelagerte eigene Anpassungen liegen momentan im „alten“ sysbuntupfad unter usr/local/src/files4sbos
- 0.3.2
- Geänderte config für semanticSBML, SemanticSBML- Daten nach /opt verschoben, da semanticsbml in der config nicht mit relativen Pfaden umgehen kann
- Doku und Optik von ubuntu4systemsbiology befreit
- 0.3.3
- Doku repariert (es fehlten die Videos!)
- …und gstreamer0.10-plugins-ugly + gstreamer0.10-ffmpeg fehlten
- Visualea startet mit xterm wegen Bug: VisuAlea plottet nur, wenn es eus einem Terminal gestartet wird.
- 0.3.4
- Fehlerbereinigte TIde-Version 1.2.1 (Versionsnummer NICHT angepasst, sollte so bleiben)
- semanticSBML jetzt 1.0.8
- usplash-theme erstellt (usplash-theme-sbos 0.3.4)
- IMMER ANPASSEN: remaster-iso/isolinux/*. Besonders auf Datum/Bezeichnung achten!
- SBMLsqueezer 1.1 installiert
- Desktop/Licenses links repariert
- Weiterhin zu ändern: checklicense.sh (besser in initrd packen oder an den Beginn der inittab)
- –> nochmal versuchen!!! gfxboot-theme verändern
- remaster-iso/.disk/* ändern!!!